PCR样本采集及保存
一、PCR 实验中细胞的采集、处理和保存
没有裂解液的情况下需要收集细胞后速冻保存细胞,有裂解液则直接裂解细胞。(Trizol裂解液中含有RNA酶抑制剂,有利于RNA的保存。)-
1、细胞板贴壁细胞收集:
细胞弃培养上清,预冷PBS轻柔洗涤保证完全去除培养基。加少量预冷的PBS用细胞刮刀将细胞收集于冻存管,4℃1500rpm离心去除上清后得到细胞,置于液氮速冻。
2、细胞团块收集:
细胞团块加1ml PBS重悬(注意不要过于剧烈造成细胞破裂),4℃ 1000rpm离心5分钟,弃上清,重复3次,4℃1500rpm离心去除上清后得到细胞,置于液氮速冻。
3、悬浮细胞收集:
将培养完成的细胞,转移至EP管,1000rpm离心5分钟,弃上清,4℃1500rpm离心去除上清后得到细胞,置于液氮速冻。
裂解:贴壁细胞去除培养基后直接加trizol,团块和悬浮细胞在收集到细胞后加适量Trizol重悬(10^6细胞之内加1mlTrizol)。所有细胞样本在加入裂解液后需要用移液器吹打至无明显细胞残渣。
4.保存与运输
收集并液氮速冻的细胞需要保存于-80℃冰箱,可保存1个月。
裂解的细胞,将细胞放入冰箱冻存(不应反复冻融,否则会使RNA降解)
-20℃下,可放置保存1个月;
-80℃下,可放置保存6个月;
二、PCR 实验中组织的采集、处理和保存
组织收集:取材应在冰上进行,取材后组织用生理盐水冲洗干净,去除血渍和污物,并剔除非研究所需的组织。取动物的组织,动作要求迅速,尽量避免样本在环境中暴露太久。
组织保存:取材完成后吸干水渍并切小块,放入已标记的冻存管中,液氮速冻后,转运至-80℃冰箱。新鲜的组织可以在-80℃冰箱保存半年左右,3年内冻存组织均可尝试进行定量PCR实验;
运输:使用大体积干冰运输;
qPCR样本制备的注意事项
足量的并且保证纯度的细胞(10^5个)或组织(30mg)
1、取动物的组织,动作要求迅速,尽量避免样本在环境中暴露太久;
2、将组织或细胞迅速放入无菌无酶的冻存管中,为保证质量,推荐选取Axygen,corning,nunc等国外品牌的冻存管;
3、在冻存管上做好标记,尽量清晰易辨;在实验记录本上做好记录,尽量详细易查;
4、将冻存管直接放入液氮中
速冻;或加入1ml Trizol 到冻存管中,再放入液氮速冻;
5、速冻2h 后,将冻存管从液氮转至-80度冰箱,可以保存6个月左右;
6、尽量及早提取组织或细胞样本中的RNA并逆转录为cDNA,因为即使冻存,降解仍然存在。
样本运输:液氮或干冰运输
7、全血千万不能放入干冰中送样,应室温保存,且采集完全血后,应尽快处理,从其中分离出所需的淋巴细胞